Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GLI3P10071 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GLI3P10071 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GLI3P10071 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GLI3P10071 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GLI3P10071 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GLI3P10071 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GLI3P10071 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GLI3P10071 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GLI3P10071 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GLI3P10071 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GLI3P10071 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GLI3P10071 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GLI3P10071 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GLI3P10071 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GLI3P10071 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GLI3P10071 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GLI3P10071 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GLI3P10071 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GLI3P10071 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GLI3P10071 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GLI3P10071 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GLI3P10071 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GLI3P10071 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GLI3P10071 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GLI3P10071 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GLI3P10071 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GLI3P10071 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GLI3P10071 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GLI3P10071 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GLI3P10071 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GLI3P10071 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GLI3P10071 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GLI3P10071 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GLI3P10071 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GLI3P10071 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GLI3P10071 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GLI3P10071 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GLI3P10071 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GLI3P10071 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GLI3P10071 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GLI3P10071 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GLI3P10071 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GLI3P10071 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GLI3P10071 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GLI3P10071 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GLI3P10071 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
GLI3P10071 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
GLI3P10071 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GLI3P10071 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GLI3P10071 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
GLI3P10071 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GLI3P10071 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GLI3P10071 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GLI3P10071 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GLI3P10071 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GLI3P10071 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GLI3P10071 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GLI3P10071 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GLI3P10071 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GLI3P10071 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GLI3P10071 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GLI3P10071 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GLI3P10071 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GLI3P10071 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GLI3P10071 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
GLI3P10071 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GLI3P10071 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GLI3P10071 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GLI3P10071 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GLI3P10071 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GLI3P10071 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
GLI3P10071 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GLI3P10071 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GLI3P10071 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GLI3P10071 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GLI3P10071 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GLI3P10071 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GLI3P10071 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
GLI3P10071 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
GLI3P10071 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
GLI3P10071 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
GLI3P10071 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GLI3P10071 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GLI3P10071 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GLI3P10071 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GLI3P10071 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
GLI3P10071 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GLI3P10071 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GLI3P10071 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GLI3P10071 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GLI3P10071 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GLI3P10071 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GLI3P10071 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GLI3P10071 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GLI3P10071 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GLI3P10071 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GLI3P10071 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
GLI3P10071 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC21.31■■□□□ 1
GLI3P10071 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms