Protein–RNA interactions for Protein: P07288

KLK3, Prostate-specific antigen, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLK3P07288 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLK3P07288 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLK3P07288 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLK3P07288 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLK3P07288 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLK3P07288 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLK3P07288 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLK3P07288 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLK3P07288 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLK3P07288 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
KLK3P07288 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLK3P07288 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLK3P07288 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLK3P07288 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLK3P07288 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLK3P07288 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLK3P07288 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLK3P07288 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLK3P07288 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLK3P07288 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLK3P07288 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLK3P07288 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLK3P07288 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLK3P07288 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLK3P07288 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLK3P07288 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLK3P07288 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLK3P07288 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLK3P07288 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLK3P07288 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLK3P07288 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLK3P07288 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLK3P07288 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLK3P07288 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLK3P07288 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLK3P07288 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLK3P07288 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLK3P07288 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLK3P07288 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLK3P07288 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLK3P07288 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLK3P07288 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLK3P07288 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLK3P07288 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLK3P07288 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLK3P07288 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLK3P07288 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLK3P07288 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLK3P07288 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLK3P07288 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLK3P07288 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLK3P07288 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLK3P07288 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLK3P07288 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLK3P07288 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLK3P07288 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLK3P07288 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
KLK3P07288 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLK3P07288 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLK3P07288 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLK3P07288 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLK3P07288 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLK3P07288 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
KLK3P07288 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLK3P07288 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
KLK3P07288 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLK3P07288 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLK3P07288 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLK3P07288 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLK3P07288 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLK3P07288 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLK3P07288 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLK3P07288 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
KLK3P07288 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLK3P07288 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLK3P07288 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLK3P07288 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLK3P07288 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLK3P07288 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLK3P07288 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLK3P07288 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLK3P07288 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLK3P07288 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLK3P07288 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLK3P07288 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLK3P07288 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLK3P07288 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLK3P07288 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLK3P07288 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLK3P07288 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLK3P07288 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLK3P07288 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLK3P07288 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLK3P07288 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLK3P07288 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLK3P07288 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLK3P07288 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLK3P07288 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLK3P07288 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLK3P07288 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms