Protein–RNA interactions for Protein: P04839

CYBB, Cytochrome b-245 heavy chain, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYBBP04839 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYBBP04839 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYBBP04839 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CYBBP04839 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYBBP04839 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CYBBP04839 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYBBP04839 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYBBP04839 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYBBP04839 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYBBP04839 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYBBP04839 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYBBP04839 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYBBP04839 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYBBP04839 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYBBP04839 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYBBP04839 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYBBP04839 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYBBP04839 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYBBP04839 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CYBBP04839 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CYBBP04839 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CYBBP04839 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CYBBP04839 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CYBBP04839 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CYBBP04839 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CYBBP04839 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CYBBP04839 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CYBBP04839 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
CYBBP04839 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CYBBP04839 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CYBBP04839 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CYBBP04839 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CYBBP04839 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CYBBP04839 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CYBBP04839 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CYBBP04839 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CYBBP04839 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
CYBBP04839 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CYBBP04839 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CYBBP04839 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CYBBP04839 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CYBBP04839 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CYBBP04839 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CYBBP04839 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CYBBP04839 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CYBBP04839 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CYBBP04839 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CYBBP04839 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CYBBP04839 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CYBBP04839 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CYBBP04839 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYBBP04839 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYBBP04839 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYBBP04839 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYBBP04839 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYBBP04839 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYBBP04839 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYBBP04839 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYBBP04839 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYBBP04839 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYBBP04839 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYBBP04839 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYBBP04839 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYBBP04839 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYBBP04839 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYBBP04839 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CYBBP04839 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CYBBP04839 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYBBP04839 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYBBP04839 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYBBP04839 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYBBP04839 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYBBP04839 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYBBP04839 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYBBP04839 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYBBP04839 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYBBP04839 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CYBBP04839 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYBBP04839 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYBBP04839 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYBBP04839 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYBBP04839 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYBBP04839 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYBBP04839 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYBBP04839 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYBBP04839 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYBBP04839 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYBBP04839 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYBBP04839 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYBBP04839 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYBBP04839 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYBBP04839 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CYBBP04839 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYBBP04839 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYBBP04839 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYBBP04839 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYBBP04839 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYBBP04839 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYBBP04839 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYBBP04839 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms