Protein–RNA interactions for Protein: O95931

CBX7, Chromobox protein homolog 7, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX7O95931 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBX7O95931 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBX7O95931 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBX7O95931 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBX7O95931 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBX7O95931 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBX7O95931 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBX7O95931 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBX7O95931 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBX7O95931 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBX7O95931 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBX7O95931 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBX7O95931 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBX7O95931 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBX7O95931 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBX7O95931 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.06
CBX7O95931 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBX7O95931 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBX7O95931 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBX7O95931 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBX7O95931 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBX7O95931 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBX7O95931 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CBX7O95931 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBX7O95931 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBX7O95931 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBX7O95931 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBX7O95931 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBX7O95931 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBX7O95931 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBX7O95931 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBX7O95931 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBX7O95931 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBX7O95931 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBX7O95931 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBX7O95931 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBX7O95931 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBX7O95931 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBX7O95931 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CBX7O95931 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CBX7O95931 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBX7O95931 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBX7O95931 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBX7O95931 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBX7O95931 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBX7O95931 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBX7O95931 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBX7O95931 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBX7O95931 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBX7O95931 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBX7O95931 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBX7O95931 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBX7O95931 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBX7O95931 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBX7O95931 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBX7O95931 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBX7O95931 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBX7O95931 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBX7O95931 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBX7O95931 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBX7O95931 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBX7O95931 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBX7O95931 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBX7O95931 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBX7O95931 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBX7O95931 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBX7O95931 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBX7O95931 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBX7O95931 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBX7O95931 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBX7O95931 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBX7O95931 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBX7O95931 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBX7O95931 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBX7O95931 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBX7O95931 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBX7O95931 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBX7O95931 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBX7O95931 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBX7O95931 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CBX7O95931 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CBX7O95931 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBX7O95931 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBX7O95931 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBX7O95931 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBX7O95931 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBX7O95931 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBX7O95931 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBX7O95931 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CBX7O95931 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBX7O95931 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBX7O95931 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBX7O95931 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBX7O95931 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBX7O95931 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBX7O95931 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBX7O95931 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBX7O95931 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBX7O95931 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBX7O95931 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms