Protein–RNA interactions for Protein: O95352

ATG7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG7O95352 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG7O95352 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG7O95352 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG7O95352 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG7O95352 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG7O95352 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG7O95352 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG7O95352 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG7O95352 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG7O95352 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG7O95352 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG7O95352 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG7O95352 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG7O95352 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG7O95352 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG7O95352 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG7O95352 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG7O95352 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG7O95352 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG7O95352 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG7O95352 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG7O95352 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG7O95352 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG7O95352 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG7O95352 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG7O95352 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG7O95352 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG7O95352 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG7O95352 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG7O95352 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG7O95352 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG7O95352 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG7O95352 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG7O95352 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG7O95352 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG7O95352 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG7O95352 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG7O95352 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG7O95352 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG7O95352 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG7O95352 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG7O95352 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG7O95352 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG7O95352 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG7O95352 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG7O95352 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATG7O95352 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATG7O95352 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATG7O95352 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATG7O95352 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATG7O95352 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATG7O95352 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATG7O95352 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATG7O95352 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATG7O95352 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATG7O95352 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATG7O95352 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATG7O95352 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATG7O95352 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATG7O95352 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATG7O95352 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATG7O95352 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATG7O95352 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATG7O95352 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATG7O95352 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATG7O95352 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ATG7O95352 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ATG7O95352 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ATG7O95352 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATG7O95352 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATG7O95352 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATG7O95352 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATG7O95352 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATG7O95352 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ATG7O95352 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ATG7O95352 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATG7O95352 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATG7O95352 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATG7O95352 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATG7O95352 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATG7O95352 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATG7O95352 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATG7O95352 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ATG7O95352 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATG7O95352 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATG7O95352 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATG7O95352 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ATG7O95352 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATG7O95352 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATG7O95352 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ATG7O95352 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATG7O95352 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATG7O95352 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATG7O95352 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATG7O95352 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATG7O95352 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATG7O95352 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATG7O95352 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATG7O95352 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATG7O95352 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms