Protein–RNA interactions for Protein: O75396

SEC22B, Vesicle-trafficking protein SEC22b, humanhuman

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22BO75396 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEC22BO75396 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEC22BO75396 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEC22BO75396 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SEC22BO75396 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEC22BO75396 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEC22BO75396 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SEC22BO75396 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEC22BO75396 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEC22BO75396 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEC22BO75396 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEC22BO75396 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SEC22BO75396 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEC22BO75396 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SEC22BO75396 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEC22BO75396 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEC22BO75396 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEC22BO75396 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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SEC22BO75396 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SEC22BO75396 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEC22BO75396 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEC22BO75396 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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SEC22BO75396 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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SEC22BO75396 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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SEC22BO75396 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEC22BO75396 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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SEC22BO75396 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEC22BO75396 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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SEC22BO75396 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEC22BO75396 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEC22BO75396 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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SEC22BO75396 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEC22BO75396 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEC22BO75396 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEC22BO75396 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEC22BO75396 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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SEC22BO75396 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEC22BO75396 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEC22BO75396 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEC22BO75396 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEC22BO75396 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEC22BO75396 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEC22BO75396 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEC22BO75396 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEC22BO75396 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEC22BO75396 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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