Protein–RNA interactions for Protein: O43819

SCO2, Protein SCO2 homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCO2O43819 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SCO2O43819 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SCO2O43819 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCO2O43819 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SCO2O43819 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCO2O43819 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SCO2O43819 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCO2O43819 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCO2O43819 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCO2O43819 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SCO2O43819 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SCO2O43819 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SCO2O43819 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCO2O43819 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCO2O43819 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCO2O43819 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCO2O43819 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCO2O43819 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SCO2O43819 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCO2O43819 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCO2O43819 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCO2O43819 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCO2O43819 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCO2O43819 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCO2O43819 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCO2O43819 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCO2O43819 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCO2O43819 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCO2O43819 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCO2O43819 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SCO2O43819 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCO2O43819 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCO2O43819 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCO2O43819 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCO2O43819 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCO2O43819 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCO2O43819 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCO2O43819 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCO2O43819 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCO2O43819 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCO2O43819 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCO2O43819 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCO2O43819 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SCO2O43819 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCO2O43819 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCO2O43819 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCO2O43819 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCO2O43819 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SCO2O43819 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCO2O43819 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCO2O43819 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCO2O43819 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SCO2O43819 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCO2O43819 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCO2O43819 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCO2O43819 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCO2O43819 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCO2O43819 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCO2O43819 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SCO2O43819 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCO2O43819 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCO2O43819 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCO2O43819 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCO2O43819 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCO2O43819 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SCO2O43819 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCO2O43819 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCO2O43819 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SCO2O43819 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCO2O43819 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCO2O43819 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCO2O43819 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCO2O43819 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SCO2O43819 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCO2O43819 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCO2O43819 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCO2O43819 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCO2O43819 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCO2O43819 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCO2O43819 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCO2O43819 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCO2O43819 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCO2O43819 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCO2O43819 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCO2O43819 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCO2O43819 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCO2O43819 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SCO2O43819 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCO2O43819 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCO2O43819 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCO2O43819 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCO2O43819 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCO2O43819 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCO2O43819 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCO2O43819 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCO2O43819 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCO2O43819 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCO2O43819 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCO2O43819 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCO2O43819 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms