Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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HOXA3O43365 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
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HOXA3O43365 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
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HOXA3O43365 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
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HOXA3O43365 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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HOXA3O43365 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
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