Protein–RNA interactions for Protein: O43248

HOXC11, Homeobox protein Hox-C11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC11O43248 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXC11O43248 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXC11O43248 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXC11O43248 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXC11O43248 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXC11O43248 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXC11O43248 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXC11O43248 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXC11O43248 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXC11O43248 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXC11O43248 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXC11O43248 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXC11O43248 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXC11O43248 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXC11O43248 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXC11O43248 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXC11O43248 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXC11O43248 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXC11O43248 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXC11O43248 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXC11O43248 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXC11O43248 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXC11O43248 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXC11O43248 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXC11O43248 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXC11O43248 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXC11O43248 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXC11O43248 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXC11O43248 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXC11O43248 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXC11O43248 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXC11O43248 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXC11O43248 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXC11O43248 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXC11O43248 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXC11O43248 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXC11O43248 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXC11O43248 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXC11O43248 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXC11O43248 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
HOXC11O43248 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
HOXC11O43248 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
HOXC11O43248 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXC11O43248 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXC11O43248 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXC11O43248 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXC11O43248 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXC11O43248 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXC11O43248 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXC11O43248 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXC11O43248 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXC11O43248 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXC11O43248 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXC11O43248 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXC11O43248 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXC11O43248 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXC11O43248 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXC11O43248 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXC11O43248 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXC11O43248 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXC11O43248 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXC11O43248 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXC11O43248 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXC11O43248 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXC11O43248 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXC11O43248 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXC11O43248 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXC11O43248 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXC11O43248 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXC11O43248 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXC11O43248 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXC11O43248 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXC11O43248 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXC11O43248 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXC11O43248 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXC11O43248 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXC11O43248 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXC11O43248 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXC11O43248 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXC11O43248 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXC11O43248 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXC11O43248 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXC11O43248 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXC11O43248 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXC11O43248 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXC11O43248 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXC11O43248 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXC11O43248 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXC11O43248 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXC11O43248 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXC11O43248 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXC11O43248 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXC11O43248 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXC11O43248 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXC11O43248 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXC11O43248 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXC11O43248 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXC11O43248 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXC11O43248 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXC11O43248 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.2 ms