Protein–RNA interactions for Protein: O14529

CUX2, Homeobox protein cut-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUX2O14529 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CUX2O14529 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CUX2O14529 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CUX2O14529 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CUX2O14529 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CUX2O14529 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CUX2O14529 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CUX2O14529 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CUX2O14529 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CUX2O14529 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CUX2O14529 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CUX2O14529 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CUX2O14529 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
CUX2O14529 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CUX2O14529 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CUX2O14529 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CUX2O14529 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CUX2O14529 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CUX2O14529 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
CUX2O14529 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CUX2O14529 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CUX2O14529 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CUX2O14529 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CUX2O14529 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CUX2O14529 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CUX2O14529 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CUX2O14529 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
CUX2O14529 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CUX2O14529 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CUX2O14529 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CUX2O14529 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CUX2O14529 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CUX2O14529 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CUX2O14529 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CUX2O14529 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CUX2O14529 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CUX2O14529 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CUX2O14529 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CUX2O14529 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CUX2O14529 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CUX2O14529 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CUX2O14529 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CUX2O14529 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CUX2O14529 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CUX2O14529 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
CUX2O14529 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CUX2O14529 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CUX2O14529 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CUX2O14529 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CUX2O14529 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CUX2O14529 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CUX2O14529 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
CUX2O14529 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CUX2O14529 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CUX2O14529 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CUX2O14529 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CUX2O14529 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CUX2O14529 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CUX2O14529 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CUX2O14529 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CUX2O14529 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CUX2O14529 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CUX2O14529 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CUX2O14529 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CUX2O14529 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CUX2O14529 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CUX2O14529 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CUX2O14529 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CUX2O14529 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
CUX2O14529 HTATIP2-205ENST00000530266 713 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CUX2O14529 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CUX2O14529 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CUX2O14529 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CUX2O14529 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CUX2O14529 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CUX2O14529 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
CUX2O14529 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CUX2O14529 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CUX2O14529 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CUX2O14529 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CUX2O14529 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CUX2O14529 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CUX2O14529 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CUX2O14529 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CUX2O14529 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CUX2O14529 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CUX2O14529 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CUX2O14529 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CUX2O14529 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CUX2O14529 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CUX2O14529 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CUX2O14529 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CUX2O14529 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CUX2O14529 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CUX2O14529 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CUX2O14529 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CUX2O14529 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CUX2O14529 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CUX2O14529 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CUX2O14529 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms