Protein–RNA interactions for Protein: C9JLJ4

USP17L13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L13C9JLJ4 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
USP17L13C9JLJ4 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
USP17L13C9JLJ4 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
USP17L13C9JLJ4 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
USP17L13C9JLJ4 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
USP17L13C9JLJ4 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
USP17L13C9JLJ4 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
USP17L13C9JLJ4 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
USP17L13C9JLJ4 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
USP17L13C9JLJ4 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
USP17L13C9JLJ4 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
USP17L13C9JLJ4 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
USP17L13C9JLJ4 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
USP17L13C9JLJ4 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
USP17L13C9JLJ4 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
USP17L13C9JLJ4 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
USP17L13C9JLJ4 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
USP17L13C9JLJ4 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
USP17L13C9JLJ4 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
USP17L13C9JLJ4 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
USP17L13C9JLJ4 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
USP17L13C9JLJ4 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
USP17L13C9JLJ4 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
USP17L13C9JLJ4 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
USP17L13C9JLJ4 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
USP17L13C9JLJ4 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
USP17L13C9JLJ4 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
USP17L13C9JLJ4 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
USP17L13C9JLJ4 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
USP17L13C9JLJ4 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
USP17L13C9JLJ4 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
USP17L13C9JLJ4 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
USP17L13C9JLJ4 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
USP17L13C9JLJ4 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
USP17L13C9JLJ4 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
USP17L13C9JLJ4 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
USP17L13C9JLJ4 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
USP17L13C9JLJ4 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
USP17L13C9JLJ4 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
USP17L13C9JLJ4 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
USP17L13C9JLJ4 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
USP17L13C9JLJ4 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
USP17L13C9JLJ4 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
USP17L13C9JLJ4 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
USP17L13C9JLJ4 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
USP17L13C9JLJ4 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
USP17L13C9JLJ4 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
USP17L13C9JLJ4 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
USP17L13C9JLJ4 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
USP17L13C9JLJ4 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
USP17L13C9JLJ4 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
USP17L13C9JLJ4 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
USP17L13C9JLJ4 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
USP17L13C9JLJ4 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
USP17L13C9JLJ4 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
USP17L13C9JLJ4 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
USP17L13C9JLJ4 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
USP17L13C9JLJ4 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
USP17L13C9JLJ4 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
USP17L13C9JLJ4 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
USP17L13C9JLJ4 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
USP17L13C9JLJ4 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
USP17L13C9JLJ4 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
USP17L13C9JLJ4 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
USP17L13C9JLJ4 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
USP17L13C9JLJ4 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
USP17L13C9JLJ4 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
USP17L13C9JLJ4 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
USP17L13C9JLJ4 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
USP17L13C9JLJ4 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
USP17L13C9JLJ4 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
USP17L13C9JLJ4 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
USP17L13C9JLJ4 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
USP17L13C9JLJ4 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
USP17L13C9JLJ4 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
USP17L13C9JLJ4 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
USP17L13C9JLJ4 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
USP17L13C9JLJ4 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
USP17L13C9JLJ4 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
USP17L13C9JLJ4 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
USP17L13C9JLJ4 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
USP17L13C9JLJ4 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
USP17L13C9JLJ4 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
USP17L13C9JLJ4 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
USP17L13C9JLJ4 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
USP17L13C9JLJ4 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
USP17L13C9JLJ4 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
USP17L13C9JLJ4 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
USP17L13C9JLJ4 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
USP17L13C9JLJ4 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
USP17L13C9JLJ4 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
USP17L13C9JLJ4 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
USP17L13C9JLJ4 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
USP17L13C9JLJ4 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
USP17L13C9JLJ4 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
USP17L13C9JLJ4 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
USP17L13C9JLJ4 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
USP17L13C9JLJ4 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
USP17L13C9JLJ4 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
USP17L13C9JLJ4 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms