Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C7

LINC00312, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00312, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00312Q9Y6C7 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC13.61□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms