Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K7

KDM2A, Lysine-specific demethylase 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM2AQ9Y2K7 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KDM2AQ9Y2K7 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KDM2AQ9Y2K7 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KDM2AQ9Y2K7 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KDM2AQ9Y2K7 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KDM2AQ9Y2K7 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KDM2AQ9Y2K7 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KDM2AQ9Y2K7 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
KDM2AQ9Y2K7 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KDM2AQ9Y2K7 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KDM2AQ9Y2K7 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KDM2AQ9Y2K7 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KDM2AQ9Y2K7 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KDM2AQ9Y2K7 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
KDM2AQ9Y2K7 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KDM2AQ9Y2K7 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KDM2AQ9Y2K7 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KDM2AQ9Y2K7 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KDM2AQ9Y2K7 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KDM2AQ9Y2K7 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KDM2AQ9Y2K7 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM2AQ9Y2K7 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM2AQ9Y2K7 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM2AQ9Y2K7 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM2AQ9Y2K7 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM2AQ9Y2K7 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM2AQ9Y2K7 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM2AQ9Y2K7 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM2AQ9Y2K7 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM2AQ9Y2K7 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM2AQ9Y2K7 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM2AQ9Y2K7 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM2AQ9Y2K7 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM2AQ9Y2K7 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM2AQ9Y2K7 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM2AQ9Y2K7 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM2AQ9Y2K7 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM2AQ9Y2K7 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM2AQ9Y2K7 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM2AQ9Y2K7 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM2AQ9Y2K7 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM2AQ9Y2K7 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM2AQ9Y2K7 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM2AQ9Y2K7 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM2AQ9Y2K7 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM2AQ9Y2K7 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM2AQ9Y2K7 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM2AQ9Y2K7 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM2AQ9Y2K7 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM2AQ9Y2K7 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM2AQ9Y2K7 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM2AQ9Y2K7 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM2AQ9Y2K7 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM2AQ9Y2K7 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM2AQ9Y2K7 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM2AQ9Y2K7 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM2AQ9Y2K7 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM2AQ9Y2K7 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM2AQ9Y2K7 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM2AQ9Y2K7 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM2AQ9Y2K7 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM2AQ9Y2K7 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM2AQ9Y2K7 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM2AQ9Y2K7 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM2AQ9Y2K7 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM2AQ9Y2K7 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM2AQ9Y2K7 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM2AQ9Y2K7 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM2AQ9Y2K7 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM2AQ9Y2K7 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM2AQ9Y2K7 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM2AQ9Y2K7 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM2AQ9Y2K7 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM2AQ9Y2K7 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM2AQ9Y2K7 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM2AQ9Y2K7 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM2AQ9Y2K7 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM2AQ9Y2K7 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM2AQ9Y2K7 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM2AQ9Y2K7 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM2AQ9Y2K7 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM2AQ9Y2K7 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM2AQ9Y2K7 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM2AQ9Y2K7 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM2AQ9Y2K7 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM2AQ9Y2K7 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM2AQ9Y2K7 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM2AQ9Y2K7 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM2AQ9Y2K7 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM2AQ9Y2K7 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KDM2AQ9Y2K7 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KDM2AQ9Y2K7 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KDM2AQ9Y2K7 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KDM2AQ9Y2K7 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KDM2AQ9Y2K7 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KDM2AQ9Y2K7 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KDM2AQ9Y2K7 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KDM2AQ9Y2K7 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KDM2AQ9Y2K7 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KDM2AQ9Y2K7 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms