Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2E8

SLC9A8, Sodium/hydrogen exchanger 8, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A8Q9Y2E8 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9A8Q9Y2E8 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9A8Q9Y2E8 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9A8Q9Y2E8 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9A8Q9Y2E8 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9A8Q9Y2E8 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9A8Q9Y2E8 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9A8Q9Y2E8 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9A8Q9Y2E8 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9A8Q9Y2E8 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9A8Q9Y2E8 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9A8Q9Y2E8 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9A8Q9Y2E8 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9A8Q9Y2E8 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC9A8Q9Y2E8 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC9A8Q9Y2E8 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC9A8Q9Y2E8 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC9A8Q9Y2E8 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC9A8Q9Y2E8 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC9A8Q9Y2E8 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC9A8Q9Y2E8 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC9A8Q9Y2E8 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC9A8Q9Y2E8 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC9A8Q9Y2E8 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC9A8Q9Y2E8 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC9A8Q9Y2E8 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC9A8Q9Y2E8 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC9A8Q9Y2E8 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC9A8Q9Y2E8 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC9A8Q9Y2E8 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC9A8Q9Y2E8 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC9A8Q9Y2E8 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC9A8Q9Y2E8 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC9A8Q9Y2E8 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC9A8Q9Y2E8 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC9A8Q9Y2E8 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC9A8Q9Y2E8 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC9A8Q9Y2E8 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC9A8Q9Y2E8 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC9A8Q9Y2E8 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC9A8Q9Y2E8 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC9A8Q9Y2E8 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC9A8Q9Y2E8 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC9A8Q9Y2E8 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC9A8Q9Y2E8 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC9A8Q9Y2E8 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC9A8Q9Y2E8 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC9A8Q9Y2E8 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC9A8Q9Y2E8 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC9A8Q9Y2E8 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC9A8Q9Y2E8 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC9A8Q9Y2E8 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC9A8Q9Y2E8 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC9A8Q9Y2E8 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC9A8Q9Y2E8 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC9A8Q9Y2E8 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC9A8Q9Y2E8 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC9A8Q9Y2E8 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC9A8Q9Y2E8 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC9A8Q9Y2E8 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC9A8Q9Y2E8 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC9A8Q9Y2E8 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC9A8Q9Y2E8 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC9A8Q9Y2E8 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC9A8Q9Y2E8 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC9A8Q9Y2E8 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC9A8Q9Y2E8 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC9A8Q9Y2E8 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC9A8Q9Y2E8 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC9A8Q9Y2E8 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC9A8Q9Y2E8 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC9A8Q9Y2E8 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC9A8Q9Y2E8 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC9A8Q9Y2E8 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC9A8Q9Y2E8 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC9A8Q9Y2E8 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC9A8Q9Y2E8 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC9A8Q9Y2E8 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC9A8Q9Y2E8 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC9A8Q9Y2E8 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC9A8Q9Y2E8 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC9A8Q9Y2E8 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC9A8Q9Y2E8 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC9A8Q9Y2E8 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC9A8Q9Y2E8 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC9A8Q9Y2E8 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC9A8Q9Y2E8 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC9A8Q9Y2E8 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC9A8Q9Y2E8 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC9A8Q9Y2E8 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC9A8Q9Y2E8 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC9A8Q9Y2E8 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC9A8Q9Y2E8 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC9A8Q9Y2E8 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC9A8Q9Y2E8 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC9A8Q9Y2E8 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC9A8Q9Y2E8 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC9A8Q9Y2E8 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC9A8Q9Y2E8 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC9A8Q9Y2E8 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms