Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKD2

MRTO4, mRNA turnover protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRTO4Q9UKD2 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms