Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC12.41□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms