Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
KCMF1Q9P0J7 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.6 ms