Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW1

RAB6B, Ras-related protein Rab-6B, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6BQ9NRW1 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB6BQ9NRW1 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB6BQ9NRW1 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB6BQ9NRW1 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB6BQ9NRW1 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB6BQ9NRW1 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB6BQ9NRW1 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB6BQ9NRW1 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB6BQ9NRW1 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB6BQ9NRW1 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB6BQ9NRW1 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB6BQ9NRW1 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB6BQ9NRW1 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB6BQ9NRW1 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB6BQ9NRW1 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB6BQ9NRW1 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB6BQ9NRW1 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB6BQ9NRW1 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB6BQ9NRW1 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB6BQ9NRW1 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB6BQ9NRW1 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB6BQ9NRW1 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB6BQ9NRW1 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB6BQ9NRW1 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB6BQ9NRW1 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB6BQ9NRW1 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB6BQ9NRW1 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB6BQ9NRW1 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB6BQ9NRW1 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB6BQ9NRW1 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB6BQ9NRW1 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB6BQ9NRW1 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB6BQ9NRW1 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB6BQ9NRW1 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB6BQ9NRW1 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB6BQ9NRW1 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB6BQ9NRW1 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB6BQ9NRW1 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB6BQ9NRW1 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB6BQ9NRW1 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB6BQ9NRW1 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB6BQ9NRW1 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB6BQ9NRW1 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB6BQ9NRW1 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB6BQ9NRW1 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB6BQ9NRW1 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB6BQ9NRW1 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB6BQ9NRW1 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB6BQ9NRW1 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB6BQ9NRW1 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB6BQ9NRW1 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB6BQ9NRW1 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB6BQ9NRW1 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB6BQ9NRW1 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB6BQ9NRW1 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB6BQ9NRW1 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB6BQ9NRW1 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB6BQ9NRW1 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB6BQ9NRW1 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB6BQ9NRW1 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB6BQ9NRW1 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB6BQ9NRW1 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB6BQ9NRW1 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB6BQ9NRW1 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB6BQ9NRW1 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB6BQ9NRW1 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB6BQ9NRW1 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB6BQ9NRW1 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB6BQ9NRW1 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB6BQ9NRW1 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB6BQ9NRW1 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB6BQ9NRW1 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB6BQ9NRW1 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB6BQ9NRW1 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAB6BQ9NRW1 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAB6BQ9NRW1 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAB6BQ9NRW1 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAB6BQ9NRW1 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAB6BQ9NRW1 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAB6BQ9NRW1 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAB6BQ9NRW1 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAB6BQ9NRW1 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAB6BQ9NRW1 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAB6BQ9NRW1 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAB6BQ9NRW1 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAB6BQ9NRW1 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAB6BQ9NRW1 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAB6BQ9NRW1 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAB6BQ9NRW1 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAB6BQ9NRW1 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAB6BQ9NRW1 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAB6BQ9NRW1 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAB6BQ9NRW1 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAB6BQ9NRW1 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAB6BQ9NRW1 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAB6BQ9NRW1 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAB6BQ9NRW1 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAB6BQ9NRW1 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAB6BQ9NRW1 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAB6BQ9NRW1 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms