Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF8

CTPS2, CTP synthase 2, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS2Q9NRF8 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTPS2Q9NRF8 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms