Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.6 ms