Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP66

HMG20A, High mobility group protein 20A, humanhuman

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20AQ9NP66 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HMG20AQ9NP66 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HMG20AQ9NP66 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HMG20AQ9NP66 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HMG20AQ9NP66 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HMG20AQ9NP66 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HMG20AQ9NP66 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HMG20AQ9NP66 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HMG20AQ9NP66 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HMG20AQ9NP66 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HMG20AQ9NP66 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HMG20AQ9NP66 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HMG20AQ9NP66 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HMG20AQ9NP66 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HMG20AQ9NP66 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HMG20AQ9NP66 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HMG20AQ9NP66 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HMG20AQ9NP66 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HMG20AQ9NP66 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HMG20AQ9NP66 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HMG20AQ9NP66 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HMG20AQ9NP66 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HMG20AQ9NP66 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HMG20AQ9NP66 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HMG20AQ9NP66 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HMG20AQ9NP66 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HMG20AQ9NP66 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HMG20AQ9NP66 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HMG20AQ9NP66 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HMG20AQ9NP66 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HMG20AQ9NP66 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HMG20AQ9NP66 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HMG20AQ9NP66 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HMG20AQ9NP66 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HMG20AQ9NP66 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HMG20AQ9NP66 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HMG20AQ9NP66 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HMG20AQ9NP66 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HMG20AQ9NP66 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HMG20AQ9NP66 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HMG20AQ9NP66 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HMG20AQ9NP66 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HMG20AQ9NP66 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HMG20AQ9NP66 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
HMG20AQ9NP66 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HMG20AQ9NP66 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HMG20AQ9NP66 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HMG20AQ9NP66 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HMG20AQ9NP66 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HMG20AQ9NP66 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HMG20AQ9NP66 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HMG20AQ9NP66 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HMG20AQ9NP66 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HMG20AQ9NP66 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HMG20AQ9NP66 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HMG20AQ9NP66 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
HMG20AQ9NP66 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HMG20AQ9NP66 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HMG20AQ9NP66 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HMG20AQ9NP66 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HMG20AQ9NP66 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HMG20AQ9NP66 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HMG20AQ9NP66 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HMG20AQ9NP66 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HMG20AQ9NP66 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HMG20AQ9NP66 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HMG20AQ9NP66 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HMG20AQ9NP66 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HMG20AQ9NP66 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HMG20AQ9NP66 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HMG20AQ9NP66 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HMG20AQ9NP66 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HMG20AQ9NP66 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HMG20AQ9NP66 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HMG20AQ9NP66 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HMG20AQ9NP66 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HMG20AQ9NP66 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HMG20AQ9NP66 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HMG20AQ9NP66 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HMG20AQ9NP66 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
HMG20AQ9NP66 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HMG20AQ9NP66 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HMG20AQ9NP66 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HMG20AQ9NP66 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HMG20AQ9NP66 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HMG20AQ9NP66 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HMG20AQ9NP66 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HMG20AQ9NP66 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
HMG20AQ9NP66 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HMG20AQ9NP66 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HMG20AQ9NP66 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HMG20AQ9NP66 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HMG20AQ9NP66 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HMG20AQ9NP66 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HMG20AQ9NP66 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HMG20AQ9NP66 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HMG20AQ9NP66 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HMG20AQ9NP66 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HMG20AQ9NP66 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
HMG20AQ9NP66 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
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