Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZX4

ROPN1B, Ropporin-1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1BQ9BZX4 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ROPN1BQ9BZX4 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ROPN1BQ9BZX4 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ROPN1BQ9BZX4 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ROPN1BQ9BZX4 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ROPN1BQ9BZX4 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ROPN1BQ9BZX4 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ROPN1BQ9BZX4 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ROPN1BQ9BZX4 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ROPN1BQ9BZX4 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ROPN1BQ9BZX4 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ROPN1BQ9BZX4 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ROPN1BQ9BZX4 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ROPN1BQ9BZX4 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ROPN1BQ9BZX4 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ROPN1BQ9BZX4 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ROPN1BQ9BZX4 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ROPN1BQ9BZX4 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ROPN1BQ9BZX4 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ROPN1BQ9BZX4 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ROPN1BQ9BZX4 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ROPN1BQ9BZX4 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ROPN1BQ9BZX4 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ROPN1BQ9BZX4 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ROPN1BQ9BZX4 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ROPN1BQ9BZX4 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ROPN1BQ9BZX4 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ROPN1BQ9BZX4 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ROPN1BQ9BZX4 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ROPN1BQ9BZX4 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ROPN1BQ9BZX4 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ROPN1BQ9BZX4 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ROPN1BQ9BZX4 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ROPN1BQ9BZX4 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
ROPN1BQ9BZX4 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ROPN1BQ9BZX4 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ROPN1BQ9BZX4 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
ROPN1BQ9BZX4 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ROPN1BQ9BZX4 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ROPN1BQ9BZX4 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ROPN1BQ9BZX4 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ROPN1BQ9BZX4 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ROPN1BQ9BZX4 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ROPN1BQ9BZX4 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ROPN1BQ9BZX4 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ROPN1BQ9BZX4 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ROPN1BQ9BZX4 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ROPN1BQ9BZX4 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ROPN1BQ9BZX4 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ROPN1BQ9BZX4 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ROPN1BQ9BZX4 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ROPN1BQ9BZX4 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ROPN1BQ9BZX4 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ROPN1BQ9BZX4 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ROPN1BQ9BZX4 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ROPN1BQ9BZX4 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ROPN1BQ9BZX4 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ROPN1BQ9BZX4 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ROPN1BQ9BZX4 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ROPN1BQ9BZX4 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ROPN1BQ9BZX4 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ROPN1BQ9BZX4 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ROPN1BQ9BZX4 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ROPN1BQ9BZX4 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ROPN1BQ9BZX4 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ROPN1BQ9BZX4 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ROPN1BQ9BZX4 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ROPN1BQ9BZX4 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ROPN1BQ9BZX4 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ROPN1BQ9BZX4 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ROPN1BQ9BZX4 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ROPN1BQ9BZX4 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ROPN1BQ9BZX4 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ROPN1BQ9BZX4 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ROPN1BQ9BZX4 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ROPN1BQ9BZX4 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ROPN1BQ9BZX4 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ROPN1BQ9BZX4 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ROPN1BQ9BZX4 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ROPN1BQ9BZX4 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ROPN1BQ9BZX4 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ROPN1BQ9BZX4 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ROPN1BQ9BZX4 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ROPN1BQ9BZX4 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ROPN1BQ9BZX4 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ROPN1BQ9BZX4 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ROPN1BQ9BZX4 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ROPN1BQ9BZX4 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ROPN1BQ9BZX4 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ROPN1BQ9BZX4 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ROPN1BQ9BZX4 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ROPN1BQ9BZX4 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ROPN1BQ9BZX4 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ROPN1BQ9BZX4 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ROPN1BQ9BZX4 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ROPN1BQ9BZX4 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ROPN1BQ9BZX4 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ROPN1BQ9BZX4 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ROPN1BQ9BZX4 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ROPN1BQ9BZX4 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms