Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR9

KRTAP2-4, Keratin-associated protein 2-4, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP2-4Q9BYR9 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 ANAPC15-217ENST00000545944 704 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms