Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 THUMPD1P1-201ENST00000400014 1041 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC7.61□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 MORF4L1P6-201ENST00000418771 268 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 C5orf58-201ENST00000421269 406 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 ID2-AS1-207ENST00000455965 794 ntTSL 4 BASIC7.61□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC109588.1-201ENST00000507759 726 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 SCARNA1-201ENST00000517138 166 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC7.61□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC087894.1-201ENST00000538359 518 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC139099.3-202ENST00000574856 439 ntTSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP005901.2-201ENST00000581690 525 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP005202.1-202ENST00000583065 748 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC080013.4-201ENST00000607624 649 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 TATDN1-221ENST00000630259 915 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
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KRTAP9-3Q9BYQ3 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
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KRTAP9-3Q9BYQ3 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC7.61□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 TTC1-201ENST00000231238 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
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KRTAP9-3Q9BYQ3 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
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KRTAP9-3Q9BYQ3 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
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KRTAP9-3Q9BYQ3 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC7.6□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 CLEC4C-205ENST00000542353 1314 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 OR5AU1-201ENST00000304418 1199 ntAPPRIS P1 BASIC7.6□□□□□ -1.19
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