Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RNF17Q9BXT8 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
RNF17Q9BXT8 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
RNF17Q9BXT8 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RNF17Q9BXT8 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RNF17Q9BXT8 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RNF17Q9BXT8 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RNF17Q9BXT8 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RNF17Q9BXT8 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RNF17Q9BXT8 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RNF17Q9BXT8 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RNF17Q9BXT8 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RNF17Q9BXT8 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RNF17Q9BXT8 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
RNF17Q9BXT8 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
RNF17Q9BXT8 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
RNF17Q9BXT8 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
RNF17Q9BXT8 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
RNF17Q9BXT8 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
RNF17Q9BXT8 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
RNF17Q9BXT8 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
RNF17Q9BXT8 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
RNF17Q9BXT8 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.39
RNF17Q9BXT8 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
RNF17Q9BXT8 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
RNF17Q9BXT8 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
RNF17Q9BXT8 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
RNF17Q9BXT8 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RNF17Q9BXT8 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RNF17Q9BXT8 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RNF17Q9BXT8 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
RNF17Q9BXT8 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RNF17Q9BXT8 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RNF17Q9BXT8 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RNF17Q9BXT8 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RNF17Q9BXT8 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RNF17Q9BXT8 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RNF17Q9BXT8 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RNF17Q9BXT8 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RNF17Q9BXT8 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RNF17Q9BXT8 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RNF17Q9BXT8 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RNF17Q9BXT8 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RNF17Q9BXT8 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RNF17Q9BXT8 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RNF17Q9BXT8 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RNF17Q9BXT8 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RNF17Q9BXT8 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
RNF17Q9BXT8 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
RNF17Q9BXT8 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
RNF17Q9BXT8 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RNF17Q9BXT8 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RNF17Q9BXT8 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RNF17Q9BXT8 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RNF17Q9BXT8 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RNF17Q9BXT8 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RNF17Q9BXT8 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RNF17Q9BXT8 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RNF17Q9BXT8 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RNF17Q9BXT8 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RNF17Q9BXT8 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RNF17Q9BXT8 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RNF17Q9BXT8 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RNF17Q9BXT8 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RNF17Q9BXT8 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RNF17Q9BXT8 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
RNF17Q9BXT8 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RNF17Q9BXT8 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RNF17Q9BXT8 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RNF17Q9BXT8 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
RNF17Q9BXT8 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RNF17Q9BXT8 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RNF17Q9BXT8 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RNF17Q9BXT8 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RNF17Q9BXT8 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RNF17Q9BXT8 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RNF17Q9BXT8 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RNF17Q9BXT8 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RNF17Q9BXT8 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RNF17Q9BXT8 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RNF17Q9BXT8 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RNF17Q9BXT8 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RNF17Q9BXT8 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RNF17Q9BXT8 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RNF17Q9BXT8 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RNF17Q9BXT8 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RNF17Q9BXT8 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RNF17Q9BXT8 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RNF17Q9BXT8 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RNF17Q9BXT8 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
RNF17Q9BXT8 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RNF17Q9BXT8 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RNF17Q9BXT8 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RNF17Q9BXT8 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RNF17Q9BXT8 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RNF17Q9BXT8 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RNF17Q9BXT8 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RNF17Q9BXT8 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RNF17Q9BXT8 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RNF17Q9BXT8 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms