Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms