Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTX3

TMEM208, Transmembrane protein 208, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM208Q9BTX3 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TMEM208Q9BTX3 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TMEM208Q9BTX3 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TMEM208Q9BTX3 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
TMEM208Q9BTX3 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TMEM208Q9BTX3 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TMEM208Q9BTX3 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TMEM208Q9BTX3 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TMEM208Q9BTX3 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TMEM208Q9BTX3 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TMEM208Q9BTX3 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TMEM208Q9BTX3 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TMEM208Q9BTX3 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TMEM208Q9BTX3 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TMEM208Q9BTX3 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TMEM208Q9BTX3 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TMEM208Q9BTX3 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TMEM208Q9BTX3 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TMEM208Q9BTX3 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TMEM208Q9BTX3 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TMEM208Q9BTX3 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TMEM208Q9BTX3 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TMEM208Q9BTX3 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TMEM208Q9BTX3 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TMEM208Q9BTX3 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TMEM208Q9BTX3 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
TMEM208Q9BTX3 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TMEM208Q9BTX3 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
TMEM208Q9BTX3 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
TMEM208Q9BTX3 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TMEM208Q9BTX3 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TMEM208Q9BTX3 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
TMEM208Q9BTX3 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TMEM208Q9BTX3 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TMEM208Q9BTX3 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TMEM208Q9BTX3 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TMEM208Q9BTX3 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TMEM208Q9BTX3 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
TMEM208Q9BTX3 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TMEM208Q9BTX3 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TMEM208Q9BTX3 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TMEM208Q9BTX3 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
TMEM208Q9BTX3 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TMEM208Q9BTX3 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TMEM208Q9BTX3 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TMEM208Q9BTX3 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TMEM208Q9BTX3 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TMEM208Q9BTX3 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TMEM208Q9BTX3 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TMEM208Q9BTX3 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TMEM208Q9BTX3 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
TMEM208Q9BTX3 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
TMEM208Q9BTX3 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
TMEM208Q9BTX3 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TMEM208Q9BTX3 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TMEM208Q9BTX3 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
TMEM208Q9BTX3 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TMEM208Q9BTX3 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TMEM208Q9BTX3 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TMEM208Q9BTX3 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TMEM208Q9BTX3 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TMEM208Q9BTX3 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TMEM208Q9BTX3 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TMEM208Q9BTX3 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TMEM208Q9BTX3 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TMEM208Q9BTX3 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TMEM208Q9BTX3 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TMEM208Q9BTX3 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TMEM208Q9BTX3 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TMEM208Q9BTX3 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TMEM208Q9BTX3 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TMEM208Q9BTX3 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TMEM208Q9BTX3 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
TMEM208Q9BTX3 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TMEM208Q9BTX3 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
TMEM208Q9BTX3 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TMEM208Q9BTX3 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TMEM208Q9BTX3 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TMEM208Q9BTX3 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TMEM208Q9BTX3 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
TMEM208Q9BTX3 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TMEM208Q9BTX3 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TMEM208Q9BTX3 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TMEM208Q9BTX3 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TMEM208Q9BTX3 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TMEM208Q9BTX3 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TMEM208Q9BTX3 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TMEM208Q9BTX3 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TMEM208Q9BTX3 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TMEM208Q9BTX3 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TMEM208Q9BTX3 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TMEM208Q9BTX3 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TMEM208Q9BTX3 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TMEM208Q9BTX3 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TMEM208Q9BTX3 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TMEM208Q9BTX3 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
TMEM208Q9BTX3 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TMEM208Q9BTX3 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TMEM208Q9BTX3 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TMEM208Q9BTX3 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms