Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ95

ECSIT, Evolutionarily conserved signaling intermediate in Toll pathway, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECSITQ9BQ95 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ECSITQ9BQ95 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ECSITQ9BQ95 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ECSITQ9BQ95 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ECSITQ9BQ95 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ECSITQ9BQ95 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ECSITQ9BQ95 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ECSITQ9BQ95 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ECSITQ9BQ95 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ECSITQ9BQ95 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ECSITQ9BQ95 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ECSITQ9BQ95 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ECSITQ9BQ95 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ECSITQ9BQ95 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ECSITQ9BQ95 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ECSITQ9BQ95 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ECSITQ9BQ95 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ECSITQ9BQ95 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ECSITQ9BQ95 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ECSITQ9BQ95 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ECSITQ9BQ95 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ECSITQ9BQ95 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ECSITQ9BQ95 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ECSITQ9BQ95 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ECSITQ9BQ95 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ECSITQ9BQ95 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ECSITQ9BQ95 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ECSITQ9BQ95 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ECSITQ9BQ95 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ECSITQ9BQ95 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ECSITQ9BQ95 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ECSITQ9BQ95 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ECSITQ9BQ95 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ECSITQ9BQ95 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ECSITQ9BQ95 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ECSITQ9BQ95 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ECSITQ9BQ95 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ECSITQ9BQ95 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ECSITQ9BQ95 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ECSITQ9BQ95 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ECSITQ9BQ95 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ECSITQ9BQ95 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ECSITQ9BQ95 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ECSITQ9BQ95 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ECSITQ9BQ95 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ECSITQ9BQ95 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ECSITQ9BQ95 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ECSITQ9BQ95 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ECSITQ9BQ95 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ECSITQ9BQ95 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ECSITQ9BQ95 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ECSITQ9BQ95 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ECSITQ9BQ95 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ECSITQ9BQ95 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ECSITQ9BQ95 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ECSITQ9BQ95 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ECSITQ9BQ95 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ECSITQ9BQ95 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ECSITQ9BQ95 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ECSITQ9BQ95 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ECSITQ9BQ95 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ECSITQ9BQ95 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ECSITQ9BQ95 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ECSITQ9BQ95 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ECSITQ9BQ95 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ECSITQ9BQ95 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ECSITQ9BQ95 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ECSITQ9BQ95 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ECSITQ9BQ95 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ECSITQ9BQ95 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ECSITQ9BQ95 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ECSITQ9BQ95 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ECSITQ9BQ95 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ECSITQ9BQ95 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ECSITQ9BQ95 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ECSITQ9BQ95 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ECSITQ9BQ95 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ECSITQ9BQ95 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ECSITQ9BQ95 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ECSITQ9BQ95 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ECSITQ9BQ95 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ECSITQ9BQ95 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ECSITQ9BQ95 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ECSITQ9BQ95 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ECSITQ9BQ95 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ECSITQ9BQ95 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ECSITQ9BQ95 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ECSITQ9BQ95 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ECSITQ9BQ95 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ECSITQ9BQ95 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ECSITQ9BQ95 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ECSITQ9BQ95 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ECSITQ9BQ95 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ECSITQ9BQ95 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ECSITQ9BQ95 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ECSITQ9BQ95 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ECSITQ9BQ95 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
ECSITQ9BQ95 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ECSITQ9BQ95 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ECSITQ9BQ95 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms