Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEMA3CQ99985 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEMA3CQ99985 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEMA3CQ99985 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEMA3CQ99985 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEMA3CQ99985 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEMA3CQ99985 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEMA3CQ99985 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEMA3CQ99985 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEMA3CQ99985 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SEMA3CQ99985 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEMA3CQ99985 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEMA3CQ99985 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEMA3CQ99985 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEMA3CQ99985 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEMA3CQ99985 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEMA3CQ99985 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEMA3CQ99985 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEMA3CQ99985 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEMA3CQ99985 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SEMA3CQ99985 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEMA3CQ99985 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEMA3CQ99985 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SEMA3CQ99985 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEMA3CQ99985 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SEMA3CQ99985 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEMA3CQ99985 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEMA3CQ99985 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEMA3CQ99985 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEMA3CQ99985 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEMA3CQ99985 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEMA3CQ99985 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEMA3CQ99985 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEMA3CQ99985 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEMA3CQ99985 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEMA3CQ99985 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEMA3CQ99985 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEMA3CQ99985 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEMA3CQ99985 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEMA3CQ99985 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEMA3CQ99985 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEMA3CQ99985 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEMA3CQ99985 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEMA3CQ99985 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEMA3CQ99985 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SEMA3CQ99985 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEMA3CQ99985 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SEMA3CQ99985 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEMA3CQ99985 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SEMA3CQ99985 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEMA3CQ99985 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEMA3CQ99985 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEMA3CQ99985 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEMA3CQ99985 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEMA3CQ99985 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEMA3CQ99985 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEMA3CQ99985 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEMA3CQ99985 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEMA3CQ99985 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEMA3CQ99985 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEMA3CQ99985 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEMA3CQ99985 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEMA3CQ99985 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SEMA3CQ99985 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEMA3CQ99985 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEMA3CQ99985 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEMA3CQ99985 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEMA3CQ99985 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEMA3CQ99985 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA3CQ99985 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA3CQ99985 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA3CQ99985 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA3CQ99985 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA3CQ99985 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA3CQ99985 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA3CQ99985 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA3CQ99985 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA3CQ99985 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA3CQ99985 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA3CQ99985 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA3CQ99985 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA3CQ99985 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA3CQ99985 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA3CQ99985 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA3CQ99985 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA3CQ99985 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA3CQ99985 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA3CQ99985 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA3CQ99985 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA3CQ99985 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA3CQ99985 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA3CQ99985 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA3CQ99985 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA3CQ99985 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA3CQ99985 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA3CQ99985 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA3CQ99985 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA3CQ99985 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA3CQ99985 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA3CQ99985 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms