Protein–RNA interactions for Protein: Q99742

NPAS1, Neuronal PAS domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS1Q99742 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NPAS1Q99742 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
NPAS1Q99742 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NPAS1Q99742 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NPAS1Q99742 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NPAS1Q99742 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NPAS1Q99742 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NPAS1Q99742 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NPAS1Q99742 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NPAS1Q99742 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NPAS1Q99742 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NPAS1Q99742 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NPAS1Q99742 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NPAS1Q99742 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPAS1Q99742 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NPAS1Q99742 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPAS1Q99742 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPAS1Q99742 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NPAS1Q99742 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPAS1Q99742 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NPAS1Q99742 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPAS1Q99742 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NPAS1Q99742 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NPAS1Q99742 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPAS1Q99742 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NPAS1Q99742 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPAS1Q99742 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NPAS1Q99742 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPAS1Q99742 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.07■□□□□ 0
NPAS1Q99742 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NPAS1Q99742 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPAS1Q99742 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NPAS1Q99742 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NPAS1Q99742 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NPAS1Q99742 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPAS1Q99742 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NPAS1Q99742 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPAS1Q99742 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
NPAS1Q99742 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPAS1Q99742 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPAS1Q99742 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
NPAS1Q99742 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NPAS1Q99742 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
NPAS1Q99742 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
NPAS1Q99742 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NPAS1Q99742 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NPAS1Q99742 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NPAS1Q99742 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NPAS1Q99742 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NPAS1Q99742 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NPAS1Q99742 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPAS1Q99742 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NPAS1Q99742 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPAS1Q99742 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPAS1Q99742 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPAS1Q99742 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NPAS1Q99742 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NPAS1Q99742 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPAS1Q99742 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NPAS1Q99742 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPAS1Q99742 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NPAS1Q99742 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPAS1Q99742 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NPAS1Q99742 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPAS1Q99742 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPAS1Q99742 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPAS1Q99742 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPAS1Q99742 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPAS1Q99742 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPAS1Q99742 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
NPAS1Q99742 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPAS1Q99742 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPAS1Q99742 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPAS1Q99742 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPAS1Q99742 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NPAS1Q99742 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPAS1Q99742 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPAS1Q99742 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NPAS1Q99742 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
NPAS1Q99742 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPAS1Q99742 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NPAS1Q99742 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NPAS1Q99742 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NPAS1Q99742 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NPAS1Q99742 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NPAS1Q99742 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NPAS1Q99742 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NPAS1Q99742 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
NPAS1Q99742 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NPAS1Q99742 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
NPAS1Q99742 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NPAS1Q99742 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
NPAS1Q99742 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
NPAS1Q99742 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NPAS1Q99742 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NPAS1Q99742 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPAS1Q99742 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPAS1Q99742 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPAS1Q99742 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NPAS1Q99742 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.9 ms