Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.2 ms