Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG2

JSRP1, Junctional sarcoplasmic reticulum protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JSRP1Q96MG2 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms