Protein–RNA interactions for Protein: Q96DC9

OTUB2, Ubiquitin thioesterase OTUB2, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUB2Q96DC9 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
OTUB2Q96DC9 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms