Protein–RNA interactions for Protein: Q96D46

NMD3, 60S ribosomal export protein NMD3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMD3Q96D46 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms