Protein–RNA interactions for Protein: Q92729

PTPRU, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, humanhuman

Predictions only

Length 1,446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRUQ92729 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PTPRUQ92729 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PTPRUQ92729 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PTPRUQ92729 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PTPRUQ92729 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PTPRUQ92729 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRUQ92729 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRUQ92729 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRUQ92729 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRUQ92729 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRUQ92729 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRUQ92729 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRUQ92729 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRUQ92729 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRUQ92729 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRUQ92729 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRUQ92729 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRUQ92729 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRUQ92729 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRUQ92729 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRUQ92729 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRUQ92729 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRUQ92729 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRUQ92729 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRUQ92729 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRUQ92729 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRUQ92729 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRUQ92729 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRUQ92729 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRUQ92729 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRUQ92729 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRUQ92729 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRUQ92729 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRUQ92729 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRUQ92729 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRUQ92729 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRUQ92729 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRUQ92729 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRUQ92729 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRUQ92729 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRUQ92729 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRUQ92729 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRUQ92729 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRUQ92729 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRUQ92729 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRUQ92729 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRUQ92729 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRUQ92729 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRUQ92729 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRUQ92729 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRUQ92729 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRUQ92729 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRUQ92729 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRUQ92729 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRUQ92729 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRUQ92729 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRUQ92729 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRUQ92729 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRUQ92729 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRUQ92729 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRUQ92729 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRUQ92729 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRUQ92729 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRUQ92729 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRUQ92729 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRUQ92729 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRUQ92729 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRUQ92729 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRUQ92729 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRUQ92729 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRUQ92729 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRUQ92729 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRUQ92729 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRUQ92729 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRUQ92729 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRUQ92729 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRUQ92729 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRUQ92729 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRUQ92729 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRUQ92729 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRUQ92729 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRUQ92729 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRUQ92729 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRUQ92729 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRUQ92729 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRUQ92729 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRUQ92729 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRUQ92729 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRUQ92729 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRUQ92729 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRUQ92729 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRUQ92729 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRUQ92729 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRUQ92729 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRUQ92729 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRUQ92729 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRUQ92729 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRUQ92729 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRUQ92729 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRUQ92729 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
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