Protein–RNA interactions for Protein: Q92623

TTC9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC9Q92623 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TTC9Q92623 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TTC9Q92623 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TTC9Q92623 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TTC9Q92623 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TTC9Q92623 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TTC9Q92623 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TTC9Q92623 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TTC9Q92623 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TTC9Q92623 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TTC9Q92623 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TTC9Q92623 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TTC9Q92623 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TTC9Q92623 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TTC9Q92623 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TTC9Q92623 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TTC9Q92623 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TTC9Q92623 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TTC9Q92623 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TTC9Q92623 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TTC9Q92623 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TTC9Q92623 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TTC9Q92623 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TTC9Q92623 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TTC9Q92623 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TTC9Q92623 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TTC9Q92623 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TTC9Q92623 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TTC9Q92623 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TTC9Q92623 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TTC9Q92623 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TTC9Q92623 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TTC9Q92623 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TTC9Q92623 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TTC9Q92623 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TTC9Q92623 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TTC9Q92623 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TTC9Q92623 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TTC9Q92623 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TTC9Q92623 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TTC9Q92623 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TTC9Q92623 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TTC9Q92623 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TTC9Q92623 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TTC9Q92623 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TTC9Q92623 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TTC9Q92623 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TTC9Q92623 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TTC9Q92623 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TTC9Q92623 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TTC9Q92623 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TTC9Q92623 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TTC9Q92623 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TTC9Q92623 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TTC9Q92623 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TTC9Q92623 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TTC9Q92623 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TTC9Q92623 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TTC9Q92623 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TTC9Q92623 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TTC9Q92623 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TTC9Q92623 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TTC9Q92623 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TTC9Q92623 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TTC9Q92623 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TTC9Q92623 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TTC9Q92623 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TTC9Q92623 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TTC9Q92623 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TTC9Q92623 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TTC9Q92623 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TTC9Q92623 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TTC9Q92623 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TTC9Q92623 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TTC9Q92623 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TTC9Q92623 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TTC9Q92623 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TTC9Q92623 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TTC9Q92623 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TTC9Q92623 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TTC9Q92623 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TTC9Q92623 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TTC9Q92623 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TTC9Q92623 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TTC9Q92623 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TTC9Q92623 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TTC9Q92623 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TTC9Q92623 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TTC9Q92623 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TTC9Q92623 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TTC9Q92623 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TTC9Q92623 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TTC9Q92623 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TTC9Q92623 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TTC9Q92623 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TTC9Q92623 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TTC9Q92623 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TTC9Q92623 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TTC9Q92623 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TTC9Q92623 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms