Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC12Q8WUD4 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms