Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND23

CARMIL3, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL3Q8ND23 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CARMIL3Q8ND23 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CARMIL3Q8ND23 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CARMIL3Q8ND23 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CARMIL3Q8ND23 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CARMIL3Q8ND23 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CARMIL3Q8ND23 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CARMIL3Q8ND23 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CARMIL3Q8ND23 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CARMIL3Q8ND23 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CARMIL3Q8ND23 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CARMIL3Q8ND23 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CARMIL3Q8ND23 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CARMIL3Q8ND23 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CARMIL3Q8ND23 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CARMIL3Q8ND23 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CARMIL3Q8ND23 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CARMIL3Q8ND23 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CARMIL3Q8ND23 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CARMIL3Q8ND23 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CARMIL3Q8ND23 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CARMIL3Q8ND23 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CARMIL3Q8ND23 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CARMIL3Q8ND23 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CARMIL3Q8ND23 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CARMIL3Q8ND23 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CARMIL3Q8ND23 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CARMIL3Q8ND23 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CARMIL3Q8ND23 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CARMIL3Q8ND23 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CARMIL3Q8ND23 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CARMIL3Q8ND23 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CARMIL3Q8ND23 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CARMIL3Q8ND23 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CARMIL3Q8ND23 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CARMIL3Q8ND23 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CARMIL3Q8ND23 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CARMIL3Q8ND23 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CARMIL3Q8ND23 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CARMIL3Q8ND23 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CARMIL3Q8ND23 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CARMIL3Q8ND23 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CARMIL3Q8ND23 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CARMIL3Q8ND23 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CARMIL3Q8ND23 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CARMIL3Q8ND23 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CARMIL3Q8ND23 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CARMIL3Q8ND23 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CARMIL3Q8ND23 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CARMIL3Q8ND23 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CARMIL3Q8ND23 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CARMIL3Q8ND23 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CARMIL3Q8ND23 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CARMIL3Q8ND23 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CARMIL3Q8ND23 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CARMIL3Q8ND23 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CARMIL3Q8ND23 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CARMIL3Q8ND23 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CARMIL3Q8ND23 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CARMIL3Q8ND23 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CARMIL3Q8ND23 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CARMIL3Q8ND23 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CARMIL3Q8ND23 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CARMIL3Q8ND23 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CARMIL3Q8ND23 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CARMIL3Q8ND23 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CARMIL3Q8ND23 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CARMIL3Q8ND23 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CARMIL3Q8ND23 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CARMIL3Q8ND23 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CARMIL3Q8ND23 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CARMIL3Q8ND23 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CARMIL3Q8ND23 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CARMIL3Q8ND23 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CARMIL3Q8ND23 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CARMIL3Q8ND23 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CARMIL3Q8ND23 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CARMIL3Q8ND23 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CARMIL3Q8ND23 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CARMIL3Q8ND23 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CARMIL3Q8ND23 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CARMIL3Q8ND23 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CARMIL3Q8ND23 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CARMIL3Q8ND23 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CARMIL3Q8ND23 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CARMIL3Q8ND23 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CARMIL3Q8ND23 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CARMIL3Q8ND23 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CARMIL3Q8ND23 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CARMIL3Q8ND23 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CARMIL3Q8ND23 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CARMIL3Q8ND23 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CARMIL3Q8ND23 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CARMIL3Q8ND23 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CARMIL3Q8ND23 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CARMIL3Q8ND23 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CARMIL3Q8ND23 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CARMIL3Q8ND23 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CARMIL3Q8ND23 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CARMIL3Q8ND23 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms