Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F7

GCSAM, Germinal center-associated signaling and motility protein, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSAMQ8N6F7 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75 ms