Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LMNTD2Q8IXW0 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms