Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 140.8 ms