Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSJ5

LRRC8E, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8EQ6NSJ5 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRRC8EQ6NSJ5 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRRC8EQ6NSJ5 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRRC8EQ6NSJ5 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRRC8EQ6NSJ5 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRRC8EQ6NSJ5 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRRC8EQ6NSJ5 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRRC8EQ6NSJ5 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRRC8EQ6NSJ5 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRRC8EQ6NSJ5 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRRC8EQ6NSJ5 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRC8EQ6NSJ5 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRC8EQ6NSJ5 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRC8EQ6NSJ5 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRC8EQ6NSJ5 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRC8EQ6NSJ5 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRC8EQ6NSJ5 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRC8EQ6NSJ5 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRC8EQ6NSJ5 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRC8EQ6NSJ5 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRC8EQ6NSJ5 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRC8EQ6NSJ5 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRC8EQ6NSJ5 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRC8EQ6NSJ5 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRC8EQ6NSJ5 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRC8EQ6NSJ5 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRC8EQ6NSJ5 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRC8EQ6NSJ5 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRC8EQ6NSJ5 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRC8EQ6NSJ5 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRC8EQ6NSJ5 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRC8EQ6NSJ5 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRC8EQ6NSJ5 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRC8EQ6NSJ5 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRC8EQ6NSJ5 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRC8EQ6NSJ5 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRC8EQ6NSJ5 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRC8EQ6NSJ5 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRC8EQ6NSJ5 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRC8EQ6NSJ5 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRC8EQ6NSJ5 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRC8EQ6NSJ5 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRC8EQ6NSJ5 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRC8EQ6NSJ5 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRC8EQ6NSJ5 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRC8EQ6NSJ5 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRC8EQ6NSJ5 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRC8EQ6NSJ5 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRC8EQ6NSJ5 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRC8EQ6NSJ5 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRC8EQ6NSJ5 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRC8EQ6NSJ5 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRC8EQ6NSJ5 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRC8EQ6NSJ5 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRC8EQ6NSJ5 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRC8EQ6NSJ5 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRC8EQ6NSJ5 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRRC8EQ6NSJ5 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRRC8EQ6NSJ5 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRRC8EQ6NSJ5 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRRC8EQ6NSJ5 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRRC8EQ6NSJ5 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRRC8EQ6NSJ5 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRRC8EQ6NSJ5 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRRC8EQ6NSJ5 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRRC8EQ6NSJ5 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRRC8EQ6NSJ5 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRRC8EQ6NSJ5 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRRC8EQ6NSJ5 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRRC8EQ6NSJ5 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRRC8EQ6NSJ5 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRRC8EQ6NSJ5 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRRC8EQ6NSJ5 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRRC8EQ6NSJ5 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LRRC8EQ6NSJ5 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRRC8EQ6NSJ5 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LRRC8EQ6NSJ5 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRRC8EQ6NSJ5 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRRC8EQ6NSJ5 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LRRC8EQ6NSJ5 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRRC8EQ6NSJ5 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRRC8EQ6NSJ5 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRRC8EQ6NSJ5 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LRRC8EQ6NSJ5 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRRC8EQ6NSJ5 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRRC8EQ6NSJ5 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRRC8EQ6NSJ5 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LRRC8EQ6NSJ5 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRRC8EQ6NSJ5 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRRC8EQ6NSJ5 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRRC8EQ6NSJ5 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRRC8EQ6NSJ5 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRRC8EQ6NSJ5 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRRC8EQ6NSJ5 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRRC8EQ6NSJ5 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRRC8EQ6NSJ5 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRRC8EQ6NSJ5 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRRC8EQ6NSJ5 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LRRC8EQ6NSJ5 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRRC8EQ6NSJ5 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms