Protein–RNA interactions for Protein: Q5XG99

LYSMD4, LysM and putative peptidoglycan-binding domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYSMD4Q5XG99 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LYSMD4Q5XG99 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms