Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWN6

FAM208B, Protein FAM208B, humanhuman

Predictions only

Length 2,430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM208BQ5VWN6 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 FABP5P3-202ENST00000477993 1027 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 SNRPF-204ENST00000552085 815 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 LINC01278-201ENST00000433061 529 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 LINC01278-206ENST00000610088 554 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 EHMT2-AS1-201ENST00000434689 373 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 AC245884.1-201ENST00000457113 529 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms