Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVW2

GARNL3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3Q5VVW2 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.6 ms