Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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C9orf135Q5VTT2 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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C9orf135Q5VTT2 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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C9orf135Q5VTT2 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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C9orf135Q5VTT2 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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C9orf135Q5VTT2 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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