Protein–RNA interactions for Protein: Q5JTC6

AMER1, APC membrane recruitment protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMER1Q5JTC6 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AMER1Q5JTC6 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AMER1Q5JTC6 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AMER1Q5JTC6 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AMER1Q5JTC6 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AMER1Q5JTC6 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AMER1Q5JTC6 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AMER1Q5JTC6 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AMER1Q5JTC6 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AMER1Q5JTC6 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AMER1Q5JTC6 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AMER1Q5JTC6 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
AMER1Q5JTC6 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AMER1Q5JTC6 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AMER1Q5JTC6 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AMER1Q5JTC6 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AMER1Q5JTC6 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AMER1Q5JTC6 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AMER1Q5JTC6 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AMER1Q5JTC6 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AMER1Q5JTC6 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AMER1Q5JTC6 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AMER1Q5JTC6 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AMER1Q5JTC6 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AMER1Q5JTC6 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AMER1Q5JTC6 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AMER1Q5JTC6 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AMER1Q5JTC6 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AMER1Q5JTC6 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AMER1Q5JTC6 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AMER1Q5JTC6 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AMER1Q5JTC6 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AMER1Q5JTC6 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AMER1Q5JTC6 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AMER1Q5JTC6 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AMER1Q5JTC6 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AMER1Q5JTC6 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AMER1Q5JTC6 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AMER1Q5JTC6 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
AMER1Q5JTC6 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AMER1Q5JTC6 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AMER1Q5JTC6 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AMER1Q5JTC6 AC084866.2-201ENST00000509956 449 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AMER1Q5JTC6 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AMER1Q5JTC6 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AMER1Q5JTC6 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AMER1Q5JTC6 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
AMER1Q5JTC6 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AMER1Q5JTC6 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AMER1Q5JTC6 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AMER1Q5JTC6 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AMER1Q5JTC6 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AMER1Q5JTC6 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AMER1Q5JTC6 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AMER1Q5JTC6 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AMER1Q5JTC6 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AMER1Q5JTC6 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
AMER1Q5JTC6 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AMER1Q5JTC6 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AMER1Q5JTC6 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AMER1Q5JTC6 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AMER1Q5JTC6 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AMER1Q5JTC6 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AMER1Q5JTC6 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AMER1Q5JTC6 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AMER1Q5JTC6 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AMER1Q5JTC6 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AMER1Q5JTC6 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
AMER1Q5JTC6 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AMER1Q5JTC6 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AMER1Q5JTC6 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AMER1Q5JTC6 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
AMER1Q5JTC6 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AMER1Q5JTC6 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AMER1Q5JTC6 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AMER1Q5JTC6 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AMER1Q5JTC6 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AMER1Q5JTC6 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AMER1Q5JTC6 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AMER1Q5JTC6 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AMER1Q5JTC6 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AMER1Q5JTC6 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AMER1Q5JTC6 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AMER1Q5JTC6 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AMER1Q5JTC6 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AMER1Q5JTC6 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AMER1Q5JTC6 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AMER1Q5JTC6 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AMER1Q5JTC6 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AMER1Q5JTC6 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AMER1Q5JTC6 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AMER1Q5JTC6 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AMER1Q5JTC6 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AMER1Q5JTC6 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AMER1Q5JTC6 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AMER1Q5JTC6 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AMER1Q5JTC6 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AMER1Q5JTC6 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AMER1Q5JTC6 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AMER1Q5JTC6 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms