Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB6CQ53S08 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB6CQ53S08 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB6CQ53S08 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB6CQ53S08 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB6CQ53S08 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB6CQ53S08 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB6CQ53S08 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB6CQ53S08 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB6CQ53S08 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB6CQ53S08 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB6CQ53S08 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB6CQ53S08 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB6CQ53S08 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB6CQ53S08 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB6CQ53S08 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB6CQ53S08 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB6CQ53S08 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB6CQ53S08 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB6CQ53S08 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB6CQ53S08 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB6CQ53S08 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB6CQ53S08 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB6CQ53S08 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB6CQ53S08 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB6CQ53S08 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB6CQ53S08 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB6CQ53S08 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB6CQ53S08 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB6CQ53S08 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB6CQ53S08 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB6CQ53S08 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB6CQ53S08 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB6CQ53S08 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB6CQ53S08 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB6CQ53S08 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB6CQ53S08 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB6CQ53S08 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB6CQ53S08 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB6CQ53S08 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB6CQ53S08 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB6CQ53S08 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB6CQ53S08 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB6CQ53S08 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB6CQ53S08 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB6CQ53S08 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB6CQ53S08 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB6CQ53S08 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB6CQ53S08 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB6CQ53S08 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB6CQ53S08 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB6CQ53S08 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB6CQ53S08 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB6CQ53S08 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB6CQ53S08 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB6CQ53S08 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB6CQ53S08 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB6CQ53S08 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB6CQ53S08 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB6CQ53S08 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB6CQ53S08 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB6CQ53S08 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB6CQ53S08 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB6CQ53S08 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB6CQ53S08 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB6CQ53S08 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB6CQ53S08 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB6CQ53S08 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB6CQ53S08 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB6CQ53S08 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB6CQ53S08 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB6CQ53S08 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB6CQ53S08 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB6CQ53S08 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB6CQ53S08 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB6CQ53S08 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB6CQ53S08 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB6CQ53S08 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB6CQ53S08 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB6CQ53S08 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB6CQ53S08 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB6CQ53S08 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB6CQ53S08 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB6CQ53S08 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB6CQ53S08 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB6CQ53S08 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB6CQ53S08 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB6CQ53S08 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB6CQ53S08 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAB6CQ53S08 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAB6CQ53S08 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAB6CQ53S08 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAB6CQ53S08 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAB6CQ53S08 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
RAB6CQ53S08 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAB6CQ53S08 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAB6CQ53S08 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAB6CQ53S08 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAB6CQ53S08 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAB6CQ53S08 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms