Protein–RNA interactions for Protein: Q53HL2

CDCA8, Borealin, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA8Q53HL2 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDCA8Q53HL2 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDCA8Q53HL2 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDCA8Q53HL2 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDCA8Q53HL2 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDCA8Q53HL2 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDCA8Q53HL2 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDCA8Q53HL2 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDCA8Q53HL2 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDCA8Q53HL2 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDCA8Q53HL2 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDCA8Q53HL2 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDCA8Q53HL2 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDCA8Q53HL2 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDCA8Q53HL2 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CDCA8Q53HL2 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDCA8Q53HL2 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDCA8Q53HL2 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDCA8Q53HL2 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDCA8Q53HL2 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDCA8Q53HL2 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDCA8Q53HL2 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDCA8Q53HL2 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CDCA8Q53HL2 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDCA8Q53HL2 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDCA8Q53HL2 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDCA8Q53HL2 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDCA8Q53HL2 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDCA8Q53HL2 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CDCA8Q53HL2 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDCA8Q53HL2 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDCA8Q53HL2 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDCA8Q53HL2 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDCA8Q53HL2 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDCA8Q53HL2 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDCA8Q53HL2 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDCA8Q53HL2 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDCA8Q53HL2 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDCA8Q53HL2 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDCA8Q53HL2 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDCA8Q53HL2 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDCA8Q53HL2 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDCA8Q53HL2 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CDCA8Q53HL2 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDCA8Q53HL2 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDCA8Q53HL2 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDCA8Q53HL2 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDCA8Q53HL2 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDCA8Q53HL2 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDCA8Q53HL2 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDCA8Q53HL2 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDCA8Q53HL2 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDCA8Q53HL2 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDCA8Q53HL2 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDCA8Q53HL2 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDCA8Q53HL2 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDCA8Q53HL2 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDCA8Q53HL2 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CDCA8Q53HL2 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CDCA8Q53HL2 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CDCA8Q53HL2 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CDCA8Q53HL2 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CDCA8Q53HL2 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CDCA8Q53HL2 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CDCA8Q53HL2 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CDCA8Q53HL2 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDCA8Q53HL2 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDCA8Q53HL2 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDCA8Q53HL2 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDCA8Q53HL2 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDCA8Q53HL2 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDCA8Q53HL2 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDCA8Q53HL2 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDCA8Q53HL2 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDCA8Q53HL2 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDCA8Q53HL2 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CDCA8Q53HL2 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDCA8Q53HL2 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDCA8Q53HL2 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDCA8Q53HL2 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDCA8Q53HL2 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CDCA8Q53HL2 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDCA8Q53HL2 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDCA8Q53HL2 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDCA8Q53HL2 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDCA8Q53HL2 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDCA8Q53HL2 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDCA8Q53HL2 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDCA8Q53HL2 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDCA8Q53HL2 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDCA8Q53HL2 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDCA8Q53HL2 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDCA8Q53HL2 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDCA8Q53HL2 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDCA8Q53HL2 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDCA8Q53HL2 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CDCA8Q53HL2 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDCA8Q53HL2 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDCA8Q53HL2 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDCA8Q53HL2 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms