Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 AL035078.1-201ENST00000531962 820 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms